Следующее сравнение было написано принимая во внимание метод diSPIM, но основные моменты применимы ко всем типам методам плоскостного освещения SPIM/LSFM.
Конфокальная микроскопия с вращающимся диском (Spinning disk confocal microscopy - SDCM) - это просто параллельная конфокальная реализация, поэтому она быстрее, но в остальном имеет те же характеристики, что и лазерная сканирующая конфокальная микроскопия.
Малая доза освещения: Метод diSPIM имеет гораздо меньшую дозу освещения и, следовательно, меньше фотообесцвечивание/фототоксичность, чем конфокальный микроскоп. Снижение дозы освещения является основной мотивацией для большинства пользователей метода SPIM. Практическое правило заключается в том, что для конфокальной фокусировки Вам нужно в X раз больше света, чем для метода SPIM, где X - количество срезов в Вашем стеке.
Разрешение по оси Z: Метод diSPIM после регистрации/объединения имеет лучшее Z-разрешение (такое же, как разрешение по XY). Следующий лучший вариант - конфокальный, который, в свою очередь, имеет лучшее разрешение Z, чем метод SPIM с одним объективом. Использование лучей Бесселя для создания светового листа может улучшить Z-разрешение для метода SPIM с одним видом («оптическое сечение»), но не приведет к значительному изменению разрешения для двух видов после регистрации/объединения.
Разрешение XY: конфокальный и SPIM методы сопоставимы.
Скорость: Методы SPIM (на один вид) и SDCM имеют сопоставимую скорость, если интенсивность лазера в методе SDCM увеличивается, чтобы компенсировать ~ 3% открытой площади дисков. Скорость считывания с камеры ограничивает максимально достижимую частоту кадров. Например, область интереса ROI 512 пикселей составляет время считывания 2.5 мс для sCMOS камеры. Допустимое время подсветки 2.5 мс дает общее время 5 мс на изображение или 200 кадров в секунду. Использование цилиндрической линзы вместо сканируемого светового листа может снизить накладные расходы на приобретение камеры.